Adaptive Information Disclosure (AID)

Tijdens mijn bezoek in Manchester hebben een aantal myGrid mensen op Scott en mijn verzoek een Taverna workflow enactor onder 9999 geinstalleerd (webapps/remotetaverna). We kunnen hiermee bv experimenteren met workflows laten draaien onder een eigen web pagina (via REST calls), maar ook om vanuit Taverna een workflow niet op je client maar op een server [...]

[Read more →]

I would like to limit the search results for the following related reasons:

Protein names are not unique between organisms. They are closer to unique within an organism. Hence, if I could limit the search to papers e.g. in the human context, I would be more certain of the meaning of a protein name.
Martijn Scheumie’s uniprot [...]

[Read more →]

I tried applyCRF, experiences:

The list output combines the ‘B-Protein’ and ‘I-Protein’ of the other output formats
The resulting names are often more than a gene symbol (e.g. ‘NRG1 gene’)
Sometimes a B-Protein is truncated and a gene symbol extension is the first I-Protein (e.g. ‘DNAse’, ‘I’)
B-Proteins can have little mistakes (e.g. ‘STA1,’), with regexp I clear comma’s [...]

[Read more →]